تم تأجيل بدء الدراسة بالمدارس المصرية اليابانية حتى العام الدراسي المقبل 2018/ 2019. وجاء في رد وزارة التربية والتعليم على الدعوى القضائية المقامة من أحد أولياء أمور الطلاب المقبولين بالمدارس اليابانية، والمطالبة بإلغاء قرار وزير التربية والتعليم بإرجاء الدراسة بهذه المدارس، أنه تقرر تأجيل الدراسة بالمدارس المصرية اليابانية للعام المقبل، وذلك في إطار توجيهات رئيس الجمهورية بضرورة ظهور مشروع المدارس المصرية اليابانية بشكل أفضل، وأن يبدأ بداية قوية بلا أي أخطاء، وأن تكون هناك جودة وشفافية في جميع الإجراءات الخاصة باختيار الطلاب والمعلمين، وضمان الاستمرارية في التجربة.
وتقدم علي حسن، المحامي وأحد أولياء أمور الطلاب المقبولين بالمدارس المصرية اليابانية، بدعوى قضائية، اختصم فيها كلًا من: رئيس الجمهورية، ووزير التربية والتعليم، مطالبًا بوقف تنفيذ القرار الصادر عن وزارة التربية والتعليم، الخاص بإرجاء بدء الدراسة بالمدارس اليابانية إلى أجل غير مسمى، واعتبار كل ما تم اتخاذه من إجراءات متعلقة بقبول الطلاب والمعلمين "كأن لم تكن". وأجلت محكمة القضاء الإداري بمجلس الدولة، الدائرة السادسة، الدعوى المقدمة من ولي الأمر، والتي نظرتها بتاريخ 24 ديسمبر الماضي، إلى 28 يناير المقبل، للسماح بتضامن عدد جديد من أولياء الامور مع المدعي، والاطلاع على المستندات المقدمة من محامي الدولة.